Irgendwo auf dem Mittelmeer treibt ein Fischerboot im Sturm. Nicht weit davon entfernt schwimmt ein Mann, der für tot gehalten wird. Einmal geborgen, entpuppt sich der vermeintlich Ertrunkene jedoch als lebendig, allerdings schwer verletzt. Innerhalb kurzer Zeit kommt er zwar wieder zu Kräften, allein seine Erinnerung an die Nacht, in der er ins Wasser fiel und in der ihm zweimal in den Rücken geschossen wurde, kehrt nicht zurück. Weil der einzige Hinweis auf die wahre Identität ein in den Oberschenkel implantierter Code für ein Schweizer Nummernkonto ist, begibt sich der Unbekannte auf direktem Weg nach Zürich. Dort stellt er fest, dass sein Name Jason Bourne ist, er in Paris wohnt und jede Menge Geld auf seinem Konto hat. Merkwürdig ist allerdings, dass Jason auch noch weitere eigene Identitäten vorfindet, jeweils komplettiert mit Reisepass, Führerschein und anderen Dokumenten. Jason beschließt, das Geld von seinem Konto mitzunehmen und schleunigst wieder zu verschwinden. Allmählich dämmert ihm, dass er zwar einerseits als Agent im Staatsdienst, andererseits aber auch als Auftragskiller tätig war. Unterdessen versucht bereits die CIA, Jason zu finden und zu beseitigen. Zu diesem Zweck werden in den europäischen Hauptstädten Schläfer geweckt. Da auch noch die Schweizer Polizei Bourne auf den Fersen ist, will dieser sich im amerikanischem Konsulat verstecken, aber auch an diesem Ort lauern die Verfolger. Bei der Flucht trifft Jason auf die deutsche Studentin Marie, die ihn für 20.000 Dollar in seine Wohnung nach Paris fährt. Auf der Reise kommen die beiden sowohl einander als auch dem gefährlichen Geheimnis um Bournes wahre Identität immer näher...

Wertung